Nouveau core pour clients classiques : Gromacs A4 et projet 10412

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Kyle Beauchamps, nouveau venu dans l’équipe, prend la suite de Peter Kasson dans le développement des cores basés sur Gromacs. Il s’occupera désormais des cores SMP A3 et du nouveau core monothread nommé A4.

Ce core est construit autour de la dernière version stable de Gromacs, la 4.5.1. Il inclus donc toutes les dernières avancées des développeurs en termes d’algorithmes de calcul. Ceci devrait ouvrir de nouvelles perspectives de recherche pour le projet Folding@Home.

Attention, ce core est le premier à nécessiter la présence du support des instructions SSE2. Ce core étant amené à prendre la place de tous les autres cores monothread basés sur Gromacs (78, 79, A0, ...), ceci pousse donc doucement les processeurs les plus anciens (avant Athlon 64 chez AMD et avant Pentium 4 chez Intel) vers la sortie … une nouvelle page se tourne.

Afin de confronter les résultats de simulations précédentes récentes, les premiers projets qui utiliseront ce core simuleront des protéines auxquelles nous avons déjà eu affaire. C’est donc tout naturellement que le projet 10412 actuellement lancé étudie cette bonne vieille protéine Villin. Cette série de projet simulera donc la tête de la protéine Villin à différentes températures et à différentes concentrations de dénaturant.

Le projet 10412 est utilisé comme base de contrôle, sans dénaturant et à une température de 300 Kelvin. Il est distribué par le serveur 171.64.65.80. Chaque unité comprend 576 atomes, rapporte 194 points et doit être retournée de préférence en moins de 13 jours et au plus tard en moins de 19 jours.

Dans un premier temps, ce projet (et donc ce core) est distribué uniquement aux machines Windows utilisant le flag –advmethods.

Source : Forum Officiel.