Combien y a-t-il d’atomes dans une unité BigAdv ?

Par , le dans Projet Folding@Home - 3 Commentaires
Certains d’entre vous l’ont peut être remarqué, le récapitulatif des projets omet d’afficher le nombre d’atomes pour les projets BigAdv (Projets 2681, 2682 et 2683). Si comme moi, vous vous demandez combien il y a d’atomes dans ces WUs vous devez rester sur votre faim …

J’ai donc décidé d’enquêter suite à la lecture de la présentation de Peter Kasson, et plus particulièrement de ce passage :

Citation:
[…]les simulations des liposomes sont énormes (de 1 à 10 millions d’atomes) et l’utilisation des clients SMP est très importante pour ces recherches.


J’ai finalement trouvé la réponse dans les fichiers de log des unités, qui contiennent plus de détails destinés aux chercheurs (ces fichiers sont transmis dans les résultats) que le FAHlog.txt … les p268x contiennent donc pas moins de 1 094 681 atomes !

Nous en avons donc plus sur ces projets : ils étudient le processus d’infection des cellules par le virus de la grippe (voir description), qui met en jeu le phénomène de fusion des liposomes (l’enveloppe graisseuse du virus fusionnant avec l’enveloppe graisseuse de la cellule attaquée). Ce processus est illustré par l’image suivante :


Fusion de liposomes.



Avec plus d’un million d’atomes dans la simulation, on comprend aisément les besoins en mémoire vive et en puissance de calcul des unités BigAdv. Nos unités SMP classiques font figure de poids plume à coté, avec leurs 147 087 atomes !